Los órganos de gobierno de la Asociación de Ferias Españolas son: la Asamblea General y la Junta Directiva.
La Asamblea General está constituida por la totalidad de los representantes de los miembros asociados, designados por sus respectivas organizaciones. Es el órgano supremo de gobierno y decisión de la asociación. Por su parte, la Junta Directiva está formada por: Presidente, Vicepresidente, Tesorero y Vocales. Cuenta además con el Secretario General, nombrado por la Junta Directiva, y con diferentes comisiones de trabajo, para el desarrollo de sus actividades.